Das Institut wird durch ein Leitungskollegium geführt, aus dessen Gruppe 1 die Geschäftsführender Leitung (GL) für ein Jahr gewählt wird.
Dem Leitungskollegium gehören derzeit folgende Personen an:
Gruppe 1
Jun.-Prof. Dr. Stefanie Acquavella-Rauch
Univ.-Prof. Dr. Axel Beer (Stellvertretende Geschäftsführende Leitung)
Univ.-Prof. Dr. Matthias Müller
Univ.-Prof. Dr. Elisabeth Oy-Marra (GL IKM, Abteilungsleitg. Kunstgeschichte)
Univ.-Prof. Dr. Klaus Pietschmann (Abteilungsleitg. Musikwissenschaft)
Univ.-Prof. Dr. Vasiliki Tsamakda (Abteilungsleitg. Christl. Archäolgie und Byz. Kunstgeschichte)
Univ.-Prof. Dr. Gregor Wedekind
Jun.-Prof. Dr. Gesa zur Nieden
Gruppe 2
stud. phil. Lena Rheinbay (Abt. KG)
stud. phil. Patrick Marx (Abt. Musikwiss.)
Gruppe 3
Akad. Dir. PD Dr. Claudia A. Meier (Abt. KG)
Stephan Münch (Abt. Musikwiss.)
Gruppe 4
Martina Granaß
Gabriele Maurer